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Concentração de metabólitos de comunidades de baixa densidade fitoplanctônicas para Metabolomics ambiental utilizando Espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear
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Concentration of Metabolites from Low-density Planktonic Communities for Environmental Metabolomics using Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy

Concentração de metabólitos de comunidades de baixa densidade fitoplanctônicas para Metabolomics ambiental utilizando Espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear

DOI:
10.3791/3163-v

•

11:47 min

•

April 07, 2012

•

, , , , ,
1Biosphere Oriented Biology Research Unit,RIKEN Advanced Science Institute, 2Graduate School of Nanobioscience, Yokohama City University, 3Advanced NMR Metabomics Research Team,RIKEN Plant Science Center, 4Graduate School of Bioagricultural Science,Nagoya University

Capítulos

  • 00:02Título
  • 01:28Preparation of filters to remove extractables and filtration of sample for metabolite concentration
  • 04:44Extraction of aqueous-soluble metabolites
  • 07:48NMR spectroscopy and data analysis
  • 11:15Conclusions

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Um método para a extração de metabólitos de comunidades planctônicas microbianas é apresentado. Amostragem comunidade inteira é obtida por filtração em filtros especialmente preparados. Após liofilização, aquosa solúveis em metabolitos são extraídos. Esta abordagem permite a aplicação da metabolômica ambientais para trans-genómica investigações de comunidades microbianas naturais ou experimentais.

Tags

ConcentrationMetabolitesLow-densityPlanktonic CommunitiesEnvironmental MetabolomicsNuclear Magnetic Resonance SpectroscopyNMR SpectroscopyGas Chromatography-mass SpectrometryGC-MSUntargeted AnalysesStructural InformationQuantitative AnalysisStatistical AnalysisMetabolite Spectra DatabasesOmics LevelsTranscriptomicsGenomicsPhysiological ResponsesTaxaSensitivityNatural Microbial Systems

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