Monitoring Equilibrium Changes in RNA Structure by 'Peroxidative' and 'Oxidative' Hydroxyl Radical Footprinting

Ravichandra Bachu; Frances-Camille S. Padlan; Sara Rouhanifard; Michael Brenowitz; J&#246;rg C. Schlatterer

doi:10.3791/3244

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"過酸化"と"酸化"ヒドロキシルラジカルフットプリントにより、RNAの構造における均衡の変化を監視する

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Monitoring Equilibrium Changes in RNA Structure by ‘Peroxidative’ and ‘Oxidative’ Hydroxyl Radical Footprinting

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"過酸化"と"酸化"ヒドロキシルラジカルフットプリントにより、RNAの構造における均衡の変化を監視する

DOI:

10.3791/3244-v

•

13:41 min

•

October 17, 2011

•

Ravichandra Bachu*¹, Frances-Camille S. Padlan*², Sara Rouhanifard, Michael Brenowitz, Jörg C. Schlatterer

¹Department of Chemistry,Hunter College , ²Department of Biochemistry,Albert Einstein College of Medicine

Capítulos

00:05Título
02:24RNA Preparation for Footprinting Experiment
04:24The Footprinting Experiment
08:09Data Analysis
10:38Analysis of RNA Fragments after Peroxidative Fenton Footprinting Reaction
12:23Conclusion

Summary

Tadução automática

このプロトコルは、Mg（II）依存性ヒドロキシルラジカルフットプリンティングの2つの方法でRNA三次構造の形成を定量化する方法について説明します。

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