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Monitoring Equilibrium Changes in RNA Structure by ‘Peroxidative’ and ‘Oxidative’ Hydroxyl Radical Footprinting

Monitoramento de mudanças na estrutura Equilibrium RNA por "peroxidativo" e "oxidativo" Footprinting Radical Hidroxila

DOI:
10.3791/3244-v

•

13:41 min

•

October 17, 2011

•

, , , ,
1Department of Chemistry,Hunter College , 2Department of Biochemistry,Albert Einstein College of Medicine

Capítulos

  • 00:05Título
  • 02:24RNA Preparation for Footprinting Experiment
  • 04:24The Footprinting Experiment
  • 08:09Data Analysis
  • 10:38Analysis of RNA Fragments after Peroxidative Fenton Footprinting Reaction
  • 12:23Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Este protocolo descreve como quantificar o Mg (II) dependente da formação de RNA estrutura terciária através de dois métodos de pegada radical hidroxila.

Tags

MonitoringEquilibrium ChangesRNA StructurePeroxidativeOxidativeHydroxyl Radical FootprintingRNA MoleculesGenetic InformationTertiary StructuresBiologic RoleRegulatorBinderCatalystNucleic AcidsPhosphodiester BackboneSingle Nucleotide ResolutionIntermolecular Contact SurfaceEquilibrium TransitionsKinetic TransitionsSolution VariableTimeProbe ExposurePolymer SamplingVideo ArticleSample PreparationMg(II)-mediated Folding Isotherms

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