Det<em> In situ</em> Hybridisering protokoll beskrevet her, gjør at en direkte lokalisering av mRNA og små RNA uttrykk på cellenivå med høy sensitivitet og spesifisitet. Prosedyren er optimalisert for parafin-embedded plantevevet seksjoner, gjelder for et bredt spekter av planter og vev, og kan være ferdig innen ti dager.