Annotation of Plant Gene Function via Combined Genomics, Metabolomics and Informatics

Takayuki Tohge; Alisdair R. Fernie

doi:10.3791/3487

/

Annotation de la fonction des gènes des plantes par l'intermédiaire de génomique, la métabolomique et combinés informatique

JoVE Journal
Biologia

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Annotation of Plant Gene Function via Combined Genomics, Metabolomics and Informatics

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Annotation de la fonction des gènes des plantes par l'intermédiaire de génomique, la métabolomique et combinés informatique

DOI:

10.3791/3487-v

•

08:09 min

•

June 17, 2012

•

Takayuki Tohge, Alisdair R. Fernie

¹Molekulare Pflanzenphysiologie,Max-Planck-Institut

Capítulos

00:05Título
01:31Extraction and Metabolite Profiling by LC-MS
03:06Data Analysis and Prediction of Metabolic Pathway and Gene List
04:31Co-expressed Gene Analysis
05:41Integration of All Information to Predict New Pathways
07:02Results: Co-regulation Network Analysis of the Anthocyanin Pathway
07:52Conclusion

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Combinaison de la génomique, l'analyse du gène co-expression et l'identification de composés cibles par métabolisme donner annotation des gènes fonctionnels.

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