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Metabolic Pathway Confirmation and Discovery Through 13C-labeling of Proteinogenic Amino Acids

Confirmação via metabólica e descoberta através 13 C-rotulagem de proteinogénicos Aminoácidos

DOI:
10.3791/3583-v

•

07:26 min

•

January 26, 2012

•

, , , , ,
1Department of Energy, Environmental and Chemical Engineering,Washington University, 2Department of Biology,Washington University, 3Department of Energy, Environmental and Chemical Engineering and Department of Biology,Washington University

Capítulos

  • 00:05Título
  • 01:16Cell Culture
  • 01:40Amino Acid Extraction
  • 02:46Amino Acid Derivatization and GC-MS Conditions
  • 04:07GC-MS Data Analysis
  • 05:41Representative GC-MS Analysis
  • 07:06Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

13 C-isótopo rotulagem é uma técnica útil para determinar o metabolismo da célula central para vários tipos de microorganismos. Depois que as células foram cultivadas com um substrato específico rotulados, GC-MS medição pode revelar vias metabólicas funcionais com base em padrões de rotulagem única no proteinogénicos aminoácidos.

Tags

Metabolic Pathway ConfirmationMetabolic Pathway Discovery13C LabelingProteinogenic Amino AcidsBioquímicaFunctional Genomics13C-assisted Metabolism AnalysisIsotopic LabelingAtom Transition PathsBiochemical NetworkTranscriptomicsProteomicsIsotopomer-assisted Analysis Of Metabolic PathwaysLabeled SubstratesMinimal MediumCarbon SourceMeasurement NoisesNon-labeled CarbonNutrient SupplementsLabeled Substrate ChoiceReaction StereochemistryIntermediate ProductsSingly Labeled Carbon SubstratesUniformly Labeled SubstratesAmino Acid Labeling PatternsGC-MS

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