इस प्रोटोकॉल को सफलतापूर्वक करने के लिए मात्रात्मक हड्डीवाला प्रजातियों भर में कई प्रकार के ऊतकों में और स्तर mRNA अभिव्यक्ति के स्थानिक पैटर्न का पता लगाने के लिए प्रयोग किया जाता है. विधि कम बहुतायत टेप का पता लगाने और एक साथ स्लाइड्स के सैकड़ों के प्रसंस्करण की अनुमति देता है. हम इस प्रोटोकॉल का उपयोग कर एक उदाहरण के रूप में एवियन भ्रूण मस्तिष्क के गठन की अभिव्यक्ति की रूपरेखा प्रस्तुत करते हैं.