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Rilevamento di Rare varianti genomiche da Sequencing pool Uso SPLINTER
JoVE Journal
Biologia
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JoVE Journal Biologia
Detection of Rare Genomic Variants from Pooled Sequencing Using SPLINTER
DOI:

14:06 min

June 23, 2012

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Capítulos

  • 00:05Título
  • 01:28Pooled PCR Library Preparation and Sequencing
  • 04:46Sequencing Reads Alignment and Analysis
  • 07:35Rare Variant Detection using SPLINTER
  • 11:11SPLINTER Results: Detection of Rare Genomic Variants from Pooled Sequencing
  • 13:24Conclusion

Summary

Tadução automática

Sequenziamento del DNA pool è una strategia rapida ed efficace per individuare le varianti rare associate a fenotipi complessi in coorti di grandi dimensioni. Qui si descrive l'analisi computazionale del pool, sequenziamento di prossima generazione di 32 geni legati al cancro utilizzando il pacchetto software SPLINTER. Questo metodo è scalabile, e applicabile a qualsiasi fenotipo di interesse.

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