É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
Capítulos
- 00:05Título
- 01:40Constructing Non-essential Query Deletion in an Hfr Cavalli Donor Strain
- 06:42Arraying E. coli F-Recipient Mutants for E. coli Synthetic Genetic Array (eSGA) Screens
- 08:45High-density Strain Mating Procedure to Generate E. coli Double Mutants
- 11:01Results: Representative Analyses of Genetic Interaction (GI) Scores for Determining Pathway-level Functional Relationships
- 13:16Conclusion
Systematiske, store syntetiske genetiske (gen-gen eller epistasis) interaktion skærme kan bruges til at udforske genetiske redundans og pathway cross-talk. Her beskriver vi en high-throughput kvantitativ syntetisk genetisk array-screening teknologi, kaldet eSGA, som vi udviklede for at kunne belyse epistatic relationer og udforske genetiske interaktion netværk i<em> Escherichia coli</em>.
Tags
Bacterial Functional NetworksPathwaysEscherichia ColiSynthetic Genetic ArraysPhenotypesPhysical InteractionsFunctional InteractionsGene-gene InteractionsGenetic InteractionsGI ScreensEpistatic DependenciesFunctional RelationshipsLarge-scale GI MapsProkaryotesFunctional AnnotationBacterial GenomesQuantitative Bacterial GI Screening MethodsE. Coli Synthetic Genetic Array (eSGA) Screening ProcedureGenome-scale Screening
