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L'esaurimento delle RNA ribosomiale per metagenomiche Gut Mosquito RNA-seq
JoVE Journal
Biologia
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JoVE Journal Biologia
Depletion of Ribosomal RNA for Mosquito Gut Metagenomic RNA-seq
DOI:

06:21 min

April 07, 2013

, ,

Capítulos

  • 00:02Título
  • 00:08Introduction
  • 00:48Mosquito Rearing
  • 01:31Mosquito gut dissection
  • 01:43Metagenomic DNA and RNA isolation
  • 02:27Ribosomal RNA depletion
  • 02:34PCR amplification of rRNA gene fragments
  • 02:48In vitro transcription of rRNA probes
  • 03:19rRNA subtraction
  • 03:39Removal of rRNA
  • 05:07Representative results
  • 05:48Conclusion

Summary

Tadução automática

Un RNA ribosomiale (rRNA), il protocollo è stato sviluppato per esaurimento arricchire RNA messaggero (mRNA) per RNA-seq del metatranscriptome intestino zanzara. Sonde rRNA di esempio specifici, che sono stati utilizzati per rimuovere rRNA mediante sottrazione, sono stati creati dalla zanzara e dei suoi microbi intestinali. Prestazioni del protocollo può comportare la rimozione di circa il 90-99% di rRNA.

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