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モスキートガットメタゲノムRNA-seqのためのリボソームRNAの枯渇
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Biologia
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JoVE Journal Biologia
Depletion of Ribosomal RNA for Mosquito Gut Metagenomic RNA-seq
DOI:

06:21 min

April 07, 2013

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Capítulos

  • 00:02Título
  • 00:08Introduction
  • 00:48Mosquito Rearing
  • 01:31Mosquito gut dissection
  • 01:43Metagenomic DNA and RNA isolation
  • 02:27Ribosomal RNA depletion
  • 02:34PCR amplification of rRNA gene fragments
  • 02:48In vitro transcription of rRNA probes
  • 03:19rRNA subtraction
  • 03:39Removal of rRNA
  • 05:07Representative results
  • 05:48Conclusion

Summary

Tadução automática

リボソームRNA(rRNA)の枯渇プロトコルは蚊腸metatranscriptomeのRNA-seqのためのメッセンジャーRNA(mRNA)を豊かにするために開発されました。引き算を介しrRNAを除去するために使用されたサンプル特定のrRNAプローブは、蚊とその腸内微生物から作成されています。プロトコルのパフォーマンスは、rRNAの約90から99パーセントの除去をもたらすことができます。

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