É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
Capítulos
- 00:02Título
- 00:08Introduction
- 00:48Mosquito Rearing
- 01:31Mosquito gut dissection
- 01:43Metagenomic DNA and RNA isolation
- 02:27Ribosomal RNA depletion
- 02:34PCR amplification of rRNA gene fragments
- 02:48In vitro transcription of rRNA probes
- 03:19rRNA subtraction
- 03:39Removal of rRNA
- 05:07Representative results
- 05:48Conclusion
En ribosomalt RNA (rRNA) uttømming protokollen ble utviklet for å berike messenger RNA (mRNA) for RNA-seq av mygg gut metatranscriptome. Sample spesifikke rRNA sonder, som ble brukt til å fjerne rRNA via subtraksjon, ble opprettet fra den mygg og dets gut mikrober. Ytelse av protokollen kan resultere i fjerning av ca 90-99% av rRNA.
