ويمكن الجمع بين لونين مناعي والتسلسل فائقة الإنتاجية (رقاقة وما يليها) تحديد ورسم خريطة التفاعلات البروتين DNA في نسيج أو خلية خط معين. المبين هو كيفية إنشاء قالب الشذرة ذات جودة عالية للتسلسل لاحقة، وذلك باستخدام الخبرة مع عامل TCF7L2 النسخ كمثال على ذلك.