Akutt traume hjernen er en alvorlig skade som ikke har noen adekvat behandling til dags dato. Multiphoton mikroskopi kan studere lengde prosessen med akutt hjernetraume utvikling og sondering terapeutiske strategier hos gnagere. To modeller av akutt hjernetraume studert med in vivo to-foton avbildning av hjernen er demonstrert i denne protokollen.