Journal
/
/
L'uso di MALDI-TOF spettrometria di massa e un database personalizzato per caratterizzare batteri indigeni ad un unico ambiente di Cave (Kartchner Caverns, AZ, USA)
JoVE Journal
Biologia
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Biologia
Use of MALDI-TOF Mass Spectrometry and a Custom Database to Characterize Bacteria Indigenous to a Unique Cave Environment (Kartchner Caverns, AZ, USA)
DOI:

11:09 min

January 02, 2015

, , ,

Capítulos

  • 00:05Título
  • 01:46Deposition on the MALDI Target
  • 02:38Mass Spectra Acquisition Using FlexControl Software
  • 03:56Database Construction Using Bionumerics Software
  • 06:41Mass Spectrum Data Analysis
  • 08:24Bacteria Identification with a Custom Database
  • 09:40Results: Similarity-coefficient-based Method Can Correctly Identify Bacteria to the Species Level
  • 10:33Conclusion

Summary

Tadução automática

This work details procedures for rapid identification of bacteria using MALDI-TOF MS. The identification procedures include spectrum acquisition, database construction, and follow up analyses. Two identification methods, similarity coefficient-based and biomarker-based methods, are presented.

Vídeos Relacionados

Read Article