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Reinigung der Unreine: Sequencing Metagenomen und Metatranscriptomes von Complex Tierassoziierte Proben

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Purifying the Impure: Sequencing Metagenomes and Metatranscriptomes from Complex Animal-associated Samples

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Reinigung der Unreine: Sequencing Metagenomen und Metatranscriptomes von Complex Tierassoziierte Proben

DOI:

10.3791/52117-v

•

11:23 min

•

December 22, 2014

•

Yan Wei Lim, Matthew Haynes, Mike Furlan, Charles E. Robertson, J. Kirk Harris, Forest Rohwer

¹Department of Biology,San Diego State University, ²DOE Joint Genome Institute, ³Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado, ⁴Department of Pediatrics, School of Medicine,University of Colorado

Capítulos

00:05Título
02:01Sample Collection and Pre-treatment
04:11Generating Viral Metagenome and Viral-like Particle Enrichment and Purification
07:12Generating Microbial Metagenome
08:57Results: Generation of Viral and Microbial Metagenomes
10:44Conclusion

Summary

Tadução automática

Mit der Mukoviszidose Atemwege als Beispiel präsentiert das Manuskript eine umfassende Workflow mit einer Kombination aus Metagenom und metatranscriptomic Ansätze, um die mikrobiellen und viralen Gemeinden in Tierassoziierte Proben zu charakterisieren.

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