Journal
/
Biologia
/
Rense Impure: Sekvense Metagenomes og Metatranscriptomes fra Komplekse Animal-assosiert Samples
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
Purifying the Impure: Sequencing Metagenomes and Metatranscriptomes from Complex Animal-associated Samples

Rense Impure: Sekvense Metagenomes og Metatranscriptomes fra Komplekse Animal-assosiert Samples

DOI:
10.3791/52117-v

•

11:23 min

•

December 22, 2014

•

, , , , ,
1Department of Biology,San Diego State University, 2DOE Joint Genome Institute, 3Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado, 4Department of Pediatrics, School of Medicine,University of Colorado

Capítulos

  • 00:05Título
  • 02:01Sample Collection and Pre-treatment
  • 04:11Generating Viral Metagenome and Viral-like Particle Enrichment and Purification
  • 07:12Generating Microbial Metagenome
  • 08:57Results: Generation of Viral and Microbial Metagenomes
  • 10:44Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Bruke cystisk fibrose airway som et eksempel, presenterer manuskriptet en omfattende arbeidsflyt består av en kombinasjon av metagenomic og metatranscriptomic tilnærminger for å karakterisere mikrobiell og viral lokalsamfunn i dyreassosierte prøver.

Tags

MetagenomicsMetatranscriptomicsHost-associated MicrobiomeCystic FibrosisSputumDNA ExtractionRNA ExtractionHigh-throughput SequencingMicrobial CommunityViral CommunityTaxonomyFunctional Analysis

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Purifying Plasmid DNA from Bacterial Colonies Using the Qiagen Miniprep Kit

Gross Dissection of the Stomach of the Lobster, Homarus Americanus

A Lectin HPLC Method to Enrich Selectively-glycosylated Peptides from Complex Biological Samples

Quantitation of γH2AX Foci in Tissue Samples

Kjemisk-blokkert Antibody Microarray for Multiplexed High-throughput profilering av bestemt protein Glykosylering i komplekse prøver

Påvisning av sjeldne genomisk Varianter fra Pooled Sekvensering Bruke Splinter

Den MultiBac Protein Complex produksjonsplattform på EMBL

Målrettet RNA sekvense analysen å karakter Gene Expression og Genomisk Endringer

Trekke membran nanorør fra gigantiske Unilamellar blemmer

Kvasi-metagenomic analyse av Salmonella fra mat og miljøprøver

Read Article