/

/

-Methyl-bindende DNA capture Sequencing for Patient Tissues

JoVE Journal
Genética

É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou comece sua avaliação gratuita.

JoVE Journal Genética

Methyl-binding DNA capture Sequencing for Patient Tissues

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

-Methyl-bindende DNA capture Sequencing for Patient Tissues

DOI:

10.3791/54131-v

•

08:40 min

•

October 31, 2016

•

Rohit R. Jadhav, Yao V. Wang, Ya-Ting Hsu, Joseph Liu, Dawn Garcia, Zhao Lai, Tim H. M. Huang, Victor X. Jin

¹Department of Molecular Medicine,University of Texas Health Science Center at San Antonio, ²Greehey Children’s Cancer Research Institute,University of Texas Health Science Center at San Antonio

Capítulos

00:05Título
01:18Methyl-binding DNA Capture
02:10Single Fraction Elution
03:08Ethanol Precipitation
04:29Sequencing
05:58Results: Sequencing of Methyl-binding DNA Capture
07:15Conclusion

Summary

Tadução automática

Hier presenteren we een protocol om het gehele genoom DNA-methylatie in grootschalige klinische patiënt screening studies met behulp van de Methyl-bindende DNA Capture sequencing (MBDCap-seq of MBD-volgende) technologie en de daaropvolgende bioinformatica analyse pijplijn te onderzoeken.

Tags

Keywords: DNA Methylation Epigenetics Patient Cohorts Biomarkers Methyl-binding DNA Capture Sequencing Genome-wide Analysis Cost-effective Sonication Fragment Size Elution Magnetic Beads

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Zuivering van hoog molecuulgewicht Genomic DNA van echte meeldauw voor Long-Read Sequencing

Optimalisatie en Vergelijkende Analyse van Plant Organellaire DNA Verrijkingsmethoden Geschikt voor Volgend Sequencing

Omvattende DNA-methyleringsanalyse met gebruikmaking van een methyle-CpG-bindende domein-opnamebaseerde methode bij patiënten met chronische lymfocytische leukemie

Robuuste DNA isolatie en High-throughput Sequencing bibliotheek bouw voor Herbarium Specimens

Retrospectieve MicroRNA Sequencing: CDNA Bibliotheek voorbereiding Protocol met behulp van formaline-vaste paraffine-ingebedde RNA Specimens

Zeldzame gebeurtenis detectie met behulp van fout-gecorrigeerd DNA en RNA Sequencing

High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)

Halfgeleider sequencing voor pre-implantatie genetische tests voor aneuploïdie

Het rangschikken van mRNA van geheel bloed gebruikend Nanogaatje het rangschikken

Microsatelliet DNA genotypering en flow Cytometrie ploidy analyses van Formalin-vaste paraffine-ingesloten Hydatidiforme molaire weefsels

Read Article