Her beskriver vi en fremgangsmåde til at visualisere og kvantificere med høj følsomhed de endogene interaktioner mellem det endoplasmatiske reticulum og mitokondrier i fikserede celler. Protokollen har en optimeret in situ nærhed ligeringsassayet målretning inositol 1,4,5-triphosphat receptor / glucose-reguleret protein 75 / spændingsafhængig anion kanal / cyclophilin D kompleks ved mitokondrierne-associerede membran interface.