Journal
/
Biologia
/
El Método chip-exo: La identificación de las interacciones proteína-ADN con zona de Base Par de precisión
JoVE Journal
Biologia
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Biologia
The ChIP-exo Method: Identifying Protein-DNA Interactions with Near Base Pair Precision
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

El Método chip-exo: La identificación de las interacciones proteína-ADN con zona de Base Par de precisión

DOI:
10.3791/55016-v

•

09:27 min

•

December 23, 2016

•

,
1Department of Molecular Physiology and Biophysics,Vanderbilt University

Capítulos

  • 00:05Título
  • 00:41Sonication of Nuclear Lysates
  • 02:31Chromatin Immunoprecipitation
  • 03:55P7 Adapter Ligation and Lambda Exonuclease Reactions
  • 05:06RecJf Nuclease, Crosslink Reversal, and P5 Adapter Ligation Reactions
  • 06:47Results: Chromatin Immunoprecipitation Exo-mediated Protein-DNA Interactions
  • 08:21Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Here, we present a protocol to achieve near base pair resolution of protein-DNA interactions. This is obtained by exonuclease treatment of DNA fragments selectively enriched by chromatin immunoprecipitation (ChIP-exo) followed by high throughput sequencing.

Tags

Keywords: ChIP-exoProtein-DNA InteractionsGene RegulationEpigeneticsTranscription MachineryChromatinSonicationNuclear LysatesChromatin ImmunoprecipitationChIP ReactionAntibody Bead Conjugates

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/55016?article_type=v

Split-ubiquitina levadura membrana base de dos híbridos (MITO) del sistema: Una poderosa herramienta para identificar interacciones proteína-proteína
check_url/pt/55016?article_type=v

Cromosómicas asociadas trampa para la identificación de largo alcance Interacciones ADN
check_url/pt/55016?article_type=v

El Protein Complex Plataforma de Producción MultiBac en el EMBL
check_url/pt/55016?article_type=v

Combinando Manipulación sola molécula y de imagen para el estudio de las interacciones proteína-ADN
check_url/pt/55016?article_type=v

La identificación de sitios de interacción proteína-proteína utilizando péptido arrays
check_url/pt/55016?article_type=v

Método para la Evaluación de los efectos de un rango de longitudes de onda e intensidades de / Terapia de luz del infrarrojo cercano Red sobre el estrés oxidativo<em> In Vitro</em
check_url/pt/55016?article_type=v

Enhanced reducido Representación bisulfito secuenciación para la Evaluación de la metilación del ADN en la Resolución Base Par
check_url/pt/55016?article_type=v

Un método para la selección de aptámeros Estructura de conmutación Aplicado a una de nanopartículas de oro ensayo colorimétrico
check_url/pt/55016?article_type=v

Ensayo de inmunoprecipitación de la cromatina para la Identificación de Arabidopsis proteína-DNA<em> En Vivo</em
check_url/pt/55016?article_type=v

-DamID siguientes: Genoma de toda la cartografía de la proteína-ADN Interacciones de alto rendimiento de secuenciación de fragmentos de ADN adenina-metilado

Read Article