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SPHIREを用いた電子冷凍顕微鏡画像からの高分解能単一粒子解析

JoVE Journal
Bioquímica

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JoVE Journal Bioquímica

High-resolution Single Particle Analysis from Electron Cryo-microscopy Images Using SPHIRE

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SPHIREを用いた電子冷凍顕微鏡画像からの高分解能単一粒子解析

DOI:

10.3791/55448-v

•

13:28 min

•

May 16, 2017

•

Toshio Moriya, Michael Saur, Markus Stabrin, Felipe Merino, Horatiu Voicu, Zhong Huang, Pawel A. Penczek, Stefan Raunser, Christos Gatsogiannis

¹Department of Structural Biochemistry,Max Planck Institute of Molecular Physiology, ²Department of Biochemistry and Molecular Biology,The University of Texas Medical School at Houston

Capítulos

00:05Título
01:16Micrograph Alignment and Particle Picking
03:482D Classification and Initial 3D Modeling
05:513D Model-refinement
07:533D Sorting and Local Resolution Estimation
10:46Results: High-resolution 3D Modeling of TcdA1
12:19Conclusion

Summary

Tadução automática

本稿では、ソフトウェアスイートSPHIREを使用して低温EM画像を処理するためのプロトコルを紹介します。現在のプロトコルは、ほぼ原子分解能を目標とするほぼすべての単一粒子EMプロジェクトに適用することができます。

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Keywords: Single Particle Analysis Electron Cryo-microscopy SPHIRE Macromolecular Complexes High-resolution Cryo-EM Particle Box Size CTF Estimation Motion Correction Dose-weighted Dose-unweighted Particle Picking

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