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ショットガンプロテオミクスにある深さの特徴付けのためLERLIC-MS / MSおよびグルタミンの定量化およびアスパラギン脱アミド
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JoVE Journal Bioquímica
LERLIC-MS/MS for In-depth Characterization and Quantification of Glutamine and Asparagine Deamidation in Shotgun Proteomics
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ショットガンプロテオミクスにある深さの特徴付けのためLERLIC-MS / MSおよびグルタミンの定量化およびアスパラギン脱アミド

DOI:
10.3791/55626-v

•

08:01 min

•

April 09, 2017

•

, ,
1Division of Structural Biology and Biochemistry, School of Biological Sciences,Nanyang Technological University

Capítulos

  • 00:05Título
  • 00:44Long-length Anion-exchange (LAX) Capillary Column Packing
  • 01:43Tissue Sample Preparation
  • 05:33One-dimension Long-length Electrostatic Repulsion-hydrophilic Interaction Chromatography-tandem Mass Spectrometry (LERLIC-MS/MS) Separation and Data Analysis
  • 06:48Results: Separation of Deamidation Isoforms of Glutamine and Asparagine by LERLIC-MS/MS
  • 07:34Conclusion

Summary

Tadução automática

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ここでは、長尺の静電反発力 - 親水性相互作用クロマトグラフィー - タンデム質量分析（LERLIC-MS / MS）方法のステップバイステップのプロトコルを提示します。これは、ショットガンプロテオミクスによってグルタミンとアスパラギン脱アミド化アイソフォームを初めて定量および特徴付けのために有効に小説の方法論です。

Tags

LERLIC-MS/MSGlutamine DeamidationAsparagine DeamidationShotgun ProteomicsPeptide SeparationAnion Exchange ChromatographyProtein QuantificationDithiothreitolIodoacetamide

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