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Retroviral Scanning: Mapping MLV Integration Sites to Define Cell-specific Regulatory Regions
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Scansione retrovirale: Mappatura dei siti di integrazione MLV per definire regioni regolatori specifiche per le cellule

DOI:
10.3791/55919-v

•

10:10 min

•

May 28, 2017

•

, , , , , , ,
1Center for Genome Research, Department of Life Sciences,University of Modena and Reggio Emilia, 2Laboratory of Chromatin and Gene Regulation During Development,Imagine Institute, 3Institute for Biomedical Technologies,CNR, 4Généthon, 5Sorbonne Paris Cité – Université Paris Descartes

Capítulos

  • 00:05Título
  • 00:45MLV Transduction of Human Cells
  • 01:41Restriction Enzyme Digestion and Linker Ligation
  • 03:05First-round Linker-mediated PCR
  • 03:43Second Round Linker-mediated PCR
  • 05:17Library Preparation and Dilution for Massive Sequencing of MLV Integration Sites
  • 07:53Results: Mapping MLV Integration into Epigenetically-defined Regulatory Regions
  • 09:23Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Qui descriviamo un protocollo per la mappatura genomica dei siti di integrazione dei vettori retrovirali basati su virus della leucemia murina Moloney nelle cellule umane.

Tags

Retroviral ScanningMLV Integration SitesCell-specific Regulatory RegionsGene TherapyGene RegulationMLV-derived Retroviral VectorEGFP Reporter GeneFlow Cytometric AnalysisGenomic DNA PreparationRestriction Enzyme DigestionLinker LigationFirst-round PCRSecond-round PCR

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