Her beskriver vi en metode som kombinerer i situ MHC-tetramer flekker med immunohistochemistry å bestemme lokaliseringen, fenotype, og antallet av antigen-spesifikke T-celler i vev. Denne protokollen brukes til å angi romlige og fenotypiske kjennetegn av antigen-spesifikke CD8 T-celler i forhold til andre celle type og strukturer i vev.