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Pesquisa baseada em padrões de dados Epigenomic usando GeNemo
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JoVE Journal Bioengenharia
Pattern-based Search of Epigenomic Data Using GeNemo

Pesquisa baseada em padrões de dados Epigenomic usando GeNemo

DOI:
10.3791/56136-v

•

06:38 min

•

October 08, 2017

•

, ,
1Department of Bioengineering,University of California San Diego

Capítulos

  • 00:00Título
  • 01:24Using GeNemo
  • 04:05Resultados
  • 04:56Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Ao contrário dos dados de sequência de DNA, epigenomic dados não são prontamente submetidos a pesquisas baseadas em texto. Aqui apresentados são os procedimentos para usar uma versão atualizada do GeNemo, uma ferramenta de Bioinformática baseado na web, para realizar pesquisas baseada em padrões para semelhanças em epigenomic dados comparando bancos de dados disponíveis on-line incluindo livre de elementos de DNA com dados do usuário.

Tags

Keywords: – GeNemo – Epigenomic Data – Pattern-based Search – DNA-binding Protein – Epigenetic Modifications – Cell Types – ENCODE – Mousington – BED Format – Bigwig Format – Search Range – Chromosome – Base Pair

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