Det här protokollet beskriver en experimentell förfarande för att kvantitativt och grundligt undersöka metabolismen av flera näringskällor. Detta arbetsflöde, baserat på en kombination av isotopiska tracer experiment och en analytisk procedur, tillåter ödet för förbrukade näringsämnen och molekyler synthetized metabolisk ursprung av mikroorganismer skall fastställas.