Journal
/
Bioquímica
/
Djupa proteomet profilering av isobariska märkning, omfattande vätskekromatografi, masspektrometri och programvara-assisted kvantifiering
JoVE Journal
Bioquímica
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Bioquímica
Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Djupa proteomet profilering av isobariska märkning, omfattande vätskekromatografi, masspektrometri och programvara-assisted kvantifiering

DOI:
10.3791/56474-v

•

10:37 min

•

November 15, 2017

•

, , , , , , ,
1St. Jude Proteomics Facility,St. Jude Children’s Research Hospital, 2Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children’s Research Hospital, 3Heilongjiang University of Chinese Medicine

Capítulos

  • 00:05Título
  • 01:00Preparation of Cells/Tissues
  • 01:45Protein Extraction, Quality Control Western Blotting, In-solution Digestion, and Peptide Desalting
  • 04:45TMT Labeling of Peptides
  • 05:50Extensive High-resolution, Basic pH LC Prefactionation
  • 06:43LC-MS/MS Preparation and Parameters
  • 07:41Results: Deep Proteome Profiling Analysis
  • 08:45Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Vi presenterar ett protokoll för att exakt kvantifiera proteiner med isobariska märkning, omfattande fraktionering, bioinformatiska verktyg och kvalitetskontroll steg i kombination med vätskekromatografi kopplats ihop till en högupplöst masspektrometer.

Tags

Proteome ProfilingIsobaric LabelingLiquid ChromatographyMass SpectrometryQuantificationProtein IdentificationProtein QuantitationBiomarker DiscoveryCell LysisProtein DigestionAcetonitrileLys-C ProteaseDTTHEPES

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/56474?article_type=v

Sheathless kapillärelektrofores-masspektrometri för Metabolic Profiling av biologiska prover
check_url/pt/56474?article_type=v

Tidsupplöst elektrosprayjonisering Väte-deuterium Exchange-masspektrometri för att studera Protein Structure and Dynamics
check_url/pt/56474?article_type=v

Lösa affinitetsrenat proteinkomplex av Blue Native PAGE och protein Korrelation profilering
check_url/pt/56474?article_type=v

En Tandem vätskekromatografi-masspektrometri baserad strategi för metabolit analys av<em> Staphylococcus aureus</em
check_url/pt/56474?article_type=v

Detektion av protein ubiquitination platser av peptidanrikning och masspektrometri
check_url/pt/56474?article_type=v

Proteom-wide kvantifiering av märkning homogenitet på nivån enda molekyl
check_url/pt/56474?article_type=v

Nitropeptid profilering och identifiering illustrerad av angiotensin II
check_url/pt/56474?article_type=v

Absolut kvantifiering av cellfri protein syntes metabolism genom omvänd fas vätskekromatografi-masspektrometri
check_url/pt/56474?article_type=v

Label-fri immunoprecipitation masspektrometri arbetsflöde för storskalig nukleär Interactome profilering
check_url/pt/56474?article_type=v

Kvantitativ analys av cellulär lipidom e av Saccharomyces Cerevisiae med hjälp av flytande kromatografi tillsammans med Tandem Mass Spectrometri

Read Article