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माइक्रोबायल प्रोटीन और विशेष मेटाबोलाइट डेटा के विश्लेषण के लिए ओपन-स्रोत MALDI TOF-MS IDBac पाइपलाइन का उपयोग करना
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Capítulos
- 00:04Título
- 01:10Preparation of MALDI Target Plates and Data Acquisition
- 02:02Installing the IDBac Software and Starting with Raw Data
- 02:47Work with Previous Experiments
- 03:22Setting up Protein Data Analysis and Creating Mirror Plots
- 04:07Clustering Samples Using Protein Data
- 04:49Customizing the Protein Dendrogram and Inserting Samples from a Separate Experiment into the Dendrogram
- 05:32Analyzing Specialized Metabolite Data and Metabolite Association Networks (MANs)
- 06:51Results: Analysis of Microbial Protein and Specialized Metabolite Data by IDBac
- 08:28Conclusion
IDBac एक खुला स्रोत मास स्पेक्ट्रोमेट्री आधारित bioinformatics पाइप लाइन है कि दोनों बरकरार प्रोटीन और विशेष चयापचय स्पेक्ट्रम से डेटा एकीकृत, जीवाणु कालोनियों से स्क्रैप सेल सामग्री पर एकत्र है. पाइप लाइन शोधकर्ताओं को तेजी से putative वर्गीकरण समूहों में जीवाणु कालोनियों के हजारों करने के लिए सैकड़ों को व्यवस्थित करने की अनुमति देता है, और आगे उन्हें विशेष चयापचय उत्पादन के आधार पर अंतर.
