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Un metodo per la ricostruzione 3D e l'analisi della realtà virtuale delle cellule gliali e neuronali
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A Method for 3D Reconstruction and Virtual Reality Analysis of Glial and Neuronal Cells
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Un metodo per la ricostruzione 3D e l'analisi della realtà virtuale delle cellule gliali e neuronali

DOI:
10.3791/59444-v

•

12:49 min

•

September 28, 2019

•

, , , , , ,
1Biological and Environmental Sciences and Engineering Division,King Abdullah University of Science and Technology, 2Visual Computing Center,King Abdullah University of Science and Technology

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:02Image Processing Using Fiji
  • 03:58Segmentation (Semi-Automated) and Reconstruction Using Ilastik 1.3.2
  • 07:433D Analysis
  • 09:41Results: 3D Reconstruction and Virtual Reality Analysis
  • 11:40Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

La pipeline descritta è progettata per la segmentazione di set di dati di microscopia elettronica più grandi di gigabyte, per estrarre morfologie intere celle. Una volta che le celle sono state ricostruite in 3D, software personalizzato progettato intorno alle esigenze individuali può essere utilizzato per eseguire un'analisi qualitativa e quantitativa direttamente in 3D, utilizzando anche la realtà virtuale per superare vista occlusione.

Tags

3D ReconstructionVirtual Reality AnalysisGlial CellsNeuronal CellsAutomated Serial Section Electron MicroscopyImage ProcessingSegmentationTrakEM2Ilastik3D ModelingStructural ImpairmentsDiagnostic StrategyImage StitchingImage Downsampling

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