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Udforskning sekvens plads til at identificere bindende sites for regulerende RNA-bindende proteiner
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Genética
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JoVE Journal Genética
Exploring Sequence Space to Identify Binding Sites for Regulatory RNA-Binding Proteins
DOI:

11:34 min

August 09, 2019

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:11Generation of DNA Random Library Pool
  • 02:14Synthesis of Pool 0 RNA
  • 04:58RNA-Protein Binding Reaction and Separation of Bound RNA
  • 08:35Reverse Transcription, PCR Amplification, and Protein Binding
  • 09:47Results: Enrichment of PTB-binding RNAs and Splice Site Switching Assay
  • 10:50Conclusion

Summary

Tadução automática

Sekvens specificitet er afgørende for genregulering. Regulatoriske proteiner, der genkender specifikke sekvenser, er vigtige for genreguleringen. Definering af funktionelle bindingssteder for sådanne proteiner er et udfordrende biologisk problem. En iterativ tilgang til identifikation af et bindingssted for et RNA-bindende protein er beskrevet her og gælder for alle RNA-bindende proteiner.

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