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Explorar el espacio de secuencia para identificar sitios de unión para proteínas reguladoras que unen el ARN
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Genética
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JoVE Journal Genética
Exploring Sequence Space to Identify Binding Sites for Regulatory RNA-Binding Proteins
DOI:

11:34 min

August 09, 2019

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:11Generation of DNA Random Library Pool
  • 02:14Synthesis of Pool 0 RNA
  • 04:58RNA-Protein Binding Reaction and Separation of Bound RNA
  • 08:35Reverse Transcription, PCR Amplification, and Protein Binding
  • 09:47Results: Enrichment of PTB-binding RNAs and Splice Site Switching Assay
  • 10:50Conclusion

Summary

Tadução automática

La especificidad de la secuencia es fundamental para la regulación genética. Las proteínas reguladoras que reconocen secuencias específicas son importantes para la regulación genética. Definir sitios de unión funcional para tales proteínas es un problema biológico desafiante. Aquí se describe un enfoque iterativo para la identificación de un sitio de unión para una proteína de unión al ARN y es aplicable a todas las proteínas de unión al ARN.

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