Genredigeringsteknologier har gjort det muligt for forskere at generere zebrafiskmutanter til at undersøge genfunktionen med relativ lethed. Her giver vi en guide til at udføre parallelle embryo genotyping og kvantificering af in situ hybridisering signaler i zebrafisk. Denne upartiske tilgang giver større nøjagtighed i fænotypiske analyser baseret på in situ hybridisering.