Journal
/
Genética
/
Identifikasjon av sirkulær RNAs ved hjelp av RNA-sekvensering
JoVE Journal
Genética
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Genética
Identification of Circular RNAs using RNA Sequencing

Identifikasjon av sirkulær RNAs ved hjelp av RNA-sekvensering

DOI:
10.3791/59981-v

•

08:25 min

•

November 14, 2019

•

, , , , , ,
1Translational Genomic Research Institute, 2Arizona Alzheimer’s Consortium, 3Banner Sun Health Research Institute

Capítulos

  • 00:05Título
  • 01:01RNase R Treatment
  • 01:58RNA Purification
  • 03:41circRNA Library Preparation
  • 06:25Results: Circular RNA Detection
  • 07:39Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Sirkulær RNAs (circRNAs) er ikke-koding RNAs som kan ha roller i transcriptional regulering og formidling interaksjoner mellom proteiner. Etter vurdering av ulike parametre for bygging av circRNA sekvensering biblioteker, en protokoll ble kompilert utnytte strandet total RNA biblioteket forberedelse med RNase R pre-behandling og er presentert her.

Tags

Circular RNARNA SequencingRNase RRNA CleanupRNA Binding BufferRNA Wash BufferAgilent BioanalyzerTapeStationTotal RNARNA InputProtocolLibrary PreparationCircRNA DetectionSample TypesFunctional Role

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Påvisning av Kopier nummer Endringer Bruke enkelt celle Sequencing

Kartlegging av RNA-RNA-interaksjoner globalt ved bruk av biotinylert psoralen

Analyse av Transcriptomic<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA sekvenseringsdata Gjennom Tuxedo Suite på Galaxy-prosjektet

Sekvens-spesifikke og selektiv anerkjennelse av Double-strandet RNAs over Single-strandet RNAs av kjemisk endret peptid nukleinsyrer

Metabolsk merking og profilering av overføring RNAs bruker Macroarrays

Retrospektiv MicroRNA sekvensering: Komplementære DNA biblioteket forberedelse protokollen bruker Formalin-fast parafin-embedded RNA prøver

Sjelden hendelse gjenkjenning feil-korrigert DNA og RNA sekvensering

Høy gjennomstrømming identifikasjon av regulatoriske gensekvenser med neste generasjons sekvensering av runde kromosom konformasjon fange (4C-seq)

Overexpressing lang Noncoding RNAs med aktivering av Gene CRISPR

Sekvensering av mRNA fra hele Blood bruke Nanopore sekvensering

Read Article