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改进小RNA-seq:减少偏差,更好地检测2'-O-甲基RNA
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Genética
Improving Small RNA-seq: Less Bias and Better Detection of 2′-O-Methyl RNAs
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改进小RNA-seq:减少偏差,更好地检测2'-O-甲基RNA
DOI:
10.3791/60056-v
•
08:49 min
•
September 16, 2019
•
Erwin L. van Dijk
,
Evangelia Eleftheriou
,
Claude Thermes
1
Institute for Integrative Biology of the Cell, UMR9198, CNRS CEA Univ Paris-Sud
,
Université Paris-Saclay
Capítulos
00:04
Título
00:33
Small RNA Isolation
02:26
Unligated 3’ Adapter Elimination
04:41
Gel Purification
05:27
Raw Sequence File Treatment
06:06
Trimmed Sequence Mapping
06:58
Results: Representative 2’-OMe RNA Detection
08:18
Conclusion
Summary
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Tadução automática
我们提出了详细的小RNA库修复协议,比标准方法的偏差小,对2'-O-甲基RNA的灵敏度提高。使用自制试剂可节省成本或使用试剂盒以方便使用本协议。
Tags
Small RNA-seq
RNA Detection
2′-O-Methyl RNAs
Unbiased Methods
Plant MicroRNAs
Gel Electrophoresis
RNA Extraction
Adapter Elimination
Magnetic Purification Beads
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