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小型RNA-seqの改善:バイアスの減少と2'-O-メチルRNAの検出の改善

JoVE Journal
Genética

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Improving Small RNA-seq: Less Bias and Better Detection of 2′-O-Methyl RNAs

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小型RNA-seqの改善:バイアスの減少と2'-O-メチルRNAの検出の改善

DOI:

10.3791/60056-v

•

08:49 min

•

September 16, 2019

•

Erwin L. van Dijk, Evangelia Eleftheriou, Claude Thermes

¹Institute for Integrative Biology of the Cell, UMR9198, CNRS CEA Univ Paris-Sud,Université Paris-Saclay

Capítulos

00:04Título
00:33Small RNA Isolation
02:26Unligated 3’ Adapter Elimination
04:41Gel Purification
05:27Raw Sequence File Treatment
06:06Trimmed Sequence Mapping
06:58Results: Representative 2’-OMe RNA Detection
08:18Conclusion

Summary

Tadução automática

我々は、標準的な方法よりもバイアスが少ない詳細な小さなRNAライブラリー修復プロトコルと2'-O-メチルRNAの感度の増加を提示する。このプロトコルは、コストを節約するために自家製試薬を使用するか、便宜上キットを使用して従うことができます。

Tags

Keywords: Small RNA-seq RNA Detection 2′-O-Methyl RNAs Unbiased Methods Plant MicroRNAs Gel Electrophoresis RNA Extraction Adapter Elimination Magnetic Purification Beads

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