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एकल कोशिकाओं के ट्रांसक्रिप्शनल प्रोफाइल का विश्लेषण करने के लिए लेजर कैप्चर माइक्रोडिसेक्शन और माइक्रोफ्लूइडिक क्यूपीसीआर का संयोजन: ओपिओइड निर्भरता के लिए एक सिस्टम जीव विज्ञान दृष्टिकोण
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Combining Laser Capture Microdissection and Microfluidic qPCR to Analyze Transcriptional Profiles of Single Cells: A Systems Biology Approach to Opioid Dependence
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एकल कोशिकाओं के ट्रांसक्रिप्शनल प्रोफाइल का विश्लेषण करने के लिए लेजर कैप्चर माइक्रोडिसेक्शन और माइक्रोफ्लूइडिक क्यूपीसीआर का संयोजन: ओपिओइड निर्भरता के लिए एक सिस्टम जीव विज्ञान दृष्टिकोण

DOI:
10.3791/60612-v

•

09:54 min

•

March 08, 2020

•

, , , ,
1Daniel Baugh Institute for Functional Genomics and Computational Biology, Department of Pathology, Anatomy, and Cell Biology,Thomas Jefferson University, 2Sidney Kimmel Medical College,Thomas Jefferson University, 3Department of Pharmacology & Physiology,Drexel University College of Medicine

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:59Preparing the Samples
  • 02:16Laser Capture Microdissection
  • 04:07Single-cell Microfluidic RT-qPCR
  • 08:08Results: Microfluidic qPCR Yields Accurate and Anatomically Specific Transcriptional Profiles of Single-Cells
  • 09:21Conclusion

Summary

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यह प्रोटोकॉल बताता है कि लेजर कैप्चर माइक्रोडिससेक्शन का उपयोग करके उच्च सटीकता और परमाणु विशिष्टता के साथ एमिग्डाला के केंद्रीय नाभिक से एकल न्यूरॉन्स, माइक्रोग्लिया और एस्ट्रोसाइट्स को कैसे इकट्ठा किया जाए। इसके अतिरिक्त, हम इन कोशिकाओं के ट्रांसक्रिप्टोम के सबसेट को मापने के लिए माइक्रोफ्लूइडिक आरटी-क्यूपीसीआर के उपयोग की व्याख्या करते हैं।

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Keywords: Laser Capture MicrodissectionMicrofluidic QPCRTranscriptional ProfilesSingle CellsSystems BiologyOpioid DependenceGene ExpressionCellular SubphenotypesAnatomic SpecificityBiological ProblemsNeuronsBrain RegionsAmygdalaEthanol DehydrationXyleneFluorescenceLCM SoftwareInfrared Laser

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