Denne protokollen beskriver en teknikk for å visualisere macrophage atferd og død i embryonale sebrafisk under Mycobacterium marinum infeksjon. Trinn for utarbeidelse av bakterier, infeksjon av embryo, og intravital mikroskopi er inkludert. Denne teknikken kan brukes til observasjon av cellulære atferd og død i lignende scenarier som involverer infeksjon eller steril betennelse.