IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector <em>Anopheles gambiae</em>

Victoria A. Ingham; Andrew Bennett; Duo Peng; Simon C. Wagstaff; Hilary Ranson

doi:10.3791/60721

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IR-TEx: uno strumento open source per l'integrazione dei dati per la trascrittomica dei Big Data progettato per il raggio del malaria Anopheles gambiae

JoVE Journal
Biologia

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IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector Anopheles gambiae

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IR-TEx: uno strumento open source per l'integrazione dei dati per la trascrittomica dei Big Data progettato per il raggio del malaria Anopheles gambiae

DOI:

10.3791/60721-v

•

08:22 min

•

January 15, 2020

•

Victoria A. Ingham, Andrew Bennett, Duo Peng, Simon C. Wagstaff, Hilary Ranson

¹Vector Biology,Liverpool School of Tropical Medicine, ²Research Computing Unit,Liverpool School of Tropical Medicine, ³Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health

Capítulos

00:04Título
00:30Using the IR-TEx Web Application
03:57Downloading and Implementing IR-TEx Locally
04:52Modifying IR-TEx for use with Different Datasets
06:05Results: Microsomal GST Contributes to Insecticide Resistance in Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii Mosquitoes from Cte D Ivoire and Burkina Faso
07:31Conclusion

Summary

Tadução automática

IR-TEx esplora i profili trascrizionali legati alla resistenza agli insetticidi nella specie Anopheles gambiae. Qui sono disponibili istruzioni complete per l'utilizzo dell'applicazione, modifiche per esplorare più set di dati trascrittomici e usare il framework per creare un database interattivo per raccolte di dati trascrittomici da qualsiasi organismo, generati in qualsiasi piattaforma.

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