Journal
/
Biologia
/
IR-TEx: en åpen kilde data integrasjon verktøyet for stor data Transcriptomics designet for malaria Vector Anopheles gambiae
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector Anopheles gambiae

IR-TEx: en åpen kilde data integrasjon verktøyet for stor data Transcriptomics designet for malaria Vector Anopheles gambiae

DOI:
10.3791/60721-v

•

08:22 min

•

January 15, 2020

•

, , , ,
1Vector Biology,Liverpool School of Tropical Medicine, 2Research Computing Unit,Liverpool School of Tropical Medicine, 3Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health

Capítulos

  • 00:04Título
  • 00:30Using the IR-TEx Web Application
  • 03:57Downloading and Implementing IR-TEx Locally
  • 04:52Modifying IR-TEx for use with Different Datasets
  • 06:05Results: Microsomal GST Contributes to Insecticide Resistance in Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii Mosquitoes from Cte D Ivoire and Burkina Faso
  • 07:31Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

IR-TEx Utforsker insektmiddel motstand-relaterte transcriptional profiler i arten Anopheles gambiae. Forutsatt her er full instruksjoner for bruk av programmet, modifikasjoner for å utforske flere transcriptomic datasett, og bruke rammeverket til å bygge en interaktiv database for samlinger av transcriptomic data fra alle organisme, generert i noen plattform.

Tags

Data IntegrationTranscriptomicsAnopheles GambiaeIR-TExWeb ApplicationGene ExpressionInsecticide ResistancePyrethroidAnopheles ColuzziiFold ChangeAdjusted P-valueData Download

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/60721?article_type=v

Protocol for Mosquito Rearing (A. gambiae)
check_url/pt/60721?article_type=v

Population Replacement Strategies for Controlling Vector Populations and the Use of Wolbachia pipientis for Genetic Drive
check_url/pt/60721?article_type=v

Protocol for RNAi Assays in Adult Mosquitoes (A. gambiae)
check_url/pt/60721?article_type=v

Building a Better Mosquito: Identifying the Genes Enabling Malaria and Dengue Fever Resistance in A. gambiae and A. aegypti Mosquitoes
check_url/pt/60721?article_type=v

Arbeidsflyt for High-innhold, Individuell Cell Kvantifisering av Fluorescent Markers fra Universal Microscope data, som støttes av Open Source Software
check_url/pt/60721?article_type=v

RNAi Trigger Levering inn<em> Anopheles gambiae</em> puppe
check_url/pt/60721?article_type=v

En effektiv In Vitro transponering metode av Transcriptionally regulert sovende skjønnhet pakket i en integrasjon defekt Lentiviral vektor
check_url/pt/60721?article_type=v

Orm-juster og Worm_CP, to åpen kildekode rørledninger for retting og kvantifisering av fluorescens bildedata hentet fra Caenorhabditis elegans
check_url/pt/60721?article_type=v

Disseksjon og immunstaining av Larval spyttkjertler fra Anopheles gambiae Mygg
check_url/pt/60721?article_type=v

Effektiv Oral RNA Interference (RNAi) Administrasjon til Voksne Anopheles gambiae Mygg

Read Article