Journal
/
Genética
/
Validering af hele genom nanopore sekventering, ved hjælp af Usutu Virus som et eksempel
JoVE Journal
Genética
This content is Free Access.
JoVE Journal Genética
Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example

Validering af hele genom nanopore sekventering, ved hjælp af Usutu Virus som et eksempel

DOI:
10.3791/60906-v

•

05:45 min

•

March 11, 2020

•

, , ,
1ErasmusMC, Department of Viroscience, WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Viral Hemorrhagic Fever Reference and Research,Erasmus University Medical Center

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:59Nanopore Data Consensus Sequence Generation
  • 02:33Nanopore Sequencing Error Profile Compensation
  • 03:54Results: Representative Nanopore Sequencing Error Rate Overview
  • 04:58Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Vi har tidligere valideret en protokol for amplicon-baseret hele genom Usutu virus (USUV) sekventering på en nanopore sekventering platform. Her beskriver vi de anvendte metoder mere detaljeret og bestemmer fejlhastigheden for nanopore R10 flowcellen.

Tags

Artificial IntelligenceAI Writing AssistantsCopywritingContent GenerationText-based ContentContent CreationAI-assisted WritingWriter’s BlockContent EfficiencyReal-time SequencingVirus Genetic SequencingNanopore SequencingUsutu VirusError RateRead CoverageSequence DataConsensus SequenceReference-based AlignmentMinimap2SamtoolsKMA

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/60906?article_type=v

Kortlægning af RNA-RNA-interaktioner globalt ved anvendelse af biotinyleret psoralen
check_url/pt/60906?article_type=v

Generation af indfødte kromatin Immunoprecipitation sekventering biblioteker for Nucleosome tæthed analyse
check_url/pt/60906?article_type=v

G2-seq: En High Throughput sekventering-baseret teknik til identifikation af sent replikerende regioner i genomet
check_url/pt/60906?article_type=v

Profilering DNA replikation Timing ved hjælp af zebrafisk som en In Vivo modelsystem.
check_url/pt/60906?article_type=v

Sjælden begivenhed registrering ved hjælp af fejl-korrigeret DNA og RNA sekventering
check_url/pt/60906?article_type=v

Ultralow Input Genome Sequencing bibliotek forberedelse fra en enkelt Tardigrade prøvemateriale
check_url/pt/60906?article_type=v

Forstærkning af nær fuld længde HIV-1 provirus for næste Generation Sequencing
check_url/pt/60906?article_type=v

Genom-redigering i pattedyr cellelinjer ved hjælp af CRISPR-Cas
check_url/pt/60906?article_type=v

Sekvensering af mRNA fra fuldblod ved hjælp af Nanopmalm sekvensering
check_url/pt/60906?article_type=v

Identifikation af cirkulære RNAs ved hjælp af RNA-sekvensering

Read Article