Journal
/
Genética
/
Tüm Genom Nanopore Sıralama doğrulama, Örnek olarak Usutu Virüs kullanarak
JoVE Journal
Genética
This content is Free Access.
JoVE Journal Genética
Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Tüm Genom Nanopore Sıralama doğrulama, Örnek olarak Usutu Virüs kullanarak

DOI:
10.3791/60906-v

•

05:45 min

•

March 11, 2020

•

, , ,
1ErasmusMC, Department of Viroscience, WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Viral Hemorrhagic Fever Reference and Research,Erasmus University Medical Center

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:59Nanopore Data Consensus Sequence Generation
  • 02:33Nanopore Sequencing Error Profile Compensation
  • 03:54Results: Representative Nanopore Sequencing Error Rate Overview
  • 04:58Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Daha önce bir nanopore sıralama platformu üzerinde amplicon tabanlı tüm genom Usutu virüsü (USUV) sıralama için bir protokol doğruladı. Burada, daha ayrıntılı olarak kullanılan yöntemleri açıklar ve nanopore R10 akış hücresinin hata oranını belirleriz.

Tags

Artificial IntelligenceAI Writing AssistantsCopywritingContent GenerationText-based ContentContent CreationAI-assisted WritingWriter’s BlockContent EfficiencyReal-time SequencingVirus Genetic SequencingNanopore SequencingUsutu VirusError RateRead CoverageSequence DataConsensus SequenceReference-based AlignmentMinimap2SamtoolsKMA

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/60906?article_type=v

RNA-RNA Etkileşmelerini Biyotinlenmiş Psooren Kullanarak Küresel Olarak Haritalama
check_url/pt/60906?article_type=v

Nucleosome yoğunluk analiz için kitaplıklarına sıralama yerli Kromatin Immunoprecipitation nesil
check_url/pt/60906?article_type=v

G2-seq: geç genom bölgelerinde çoğaltma tanımlamak için bir yüksek işlem hacmi-dayandırılmış tekniği
check_url/pt/60906?article_type=v

Zebra balığı bir Vivo içinde Model sistemi olarak kullanarak DNA çoğaltma zamanlaması profil oluşturma
check_url/pt/60906?article_type=v

Nadiren de olsa algılama hatası düzeltildi DNA ve RNA sıralama
check_url/pt/60906?article_type=v

Ultralow giriş genom Kütüphane hazırlık bir tek Tardigrade örnekten sıralama
check_url/pt/60906?article_type=v

Amplifikasyon tam uzunlukta HIV-1 Proviruses yakınındaki yeni nesil sıralama için
check_url/pt/60906?article_type=v

Memeli hücre CRISPR-Cas kullanarak satırları genom düzenleme
check_url/pt/60906?article_type=v

Nanopore sıralamayı kullanarak tüm kan mRNA sıralaması
check_url/pt/60906?article_type=v

RNA Sıralaması Kullanılarak Dairesel RNA'ların Tanımlanması

Read Article