Journal
/
Genética
/
Identifikation af forstærker-promotor kontakter i embryolede organer ved kvantitative kromosom kropsbygning Capture (4C)
JoVE Journal
Genética
This content is Free Access.
JoVE Journal Genética
Identification of Enhancer-Promoter Contacts in Embryoid Bodies by Quantitative Chromosome Conformation Capture (4C)

Identifikation af forstærker-promotor kontakter i embryolede organer ved kvantitative kromosom kropsbygning Capture (4C)

DOI:
10.3791/60960-v

•

10:02 min

•

April 29, 2020

•

, , ,
1Center for Genomic Regulation (CRG),The Barcelona Institute of Science and Technology, 2Universitat Pompeu Fabra, 3Vall d’Hebron Institute of Oncology

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:42Embyroid Body Generation
  • 02:51Dissociation of EBs
  • 03:48Fixation
  • 04:21Cell Lysis
  • 05:03Restriction Enzyme Digestion
  • 06:34DNA Shearing and Size Selection
  • 07:31Results: Enhance-Promoter Contacts During EB Differentiation
  • 09:13Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Vi rapporterer om anvendelsen af kvantitativ kromosomkropsformation efterfulgt af sekvensering med høj gennemløb i embryoide kroppe, der stammer fra embryonale stamceller. Denne teknik gør det muligt at identificere og koronere kontakterne mellem formodede smagsforstærkere og promotorregioner for et givet gen under embryonal stamcelledifferentiering.

Tags

Keywords: 4CChromosome Conformation CaptureEnhancer-promoter ContactsEmbryoid BodiesMouse Embryonic Stem CellsGene RegulationCis-regulatory ElementsChromatin InteractionsCell CultureCell Differentiation

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/60960?article_type=v

Fremskyndet stråling Biodosimetry automatiseret ved Dicentric kromosom identifikation (ADCI) og dosis estimering
check_url/pt/60960?article_type=v

Poolet shRNA skærmen for reaktivering af MeCP2 på det inaktive X kromosom
check_url/pt/60960?article_type=v

Generation af Genome-wide kromatin kropsbygning Capture biblioteker fra stramt iscenesatte tidlige Drosophila embryoner
check_url/pt/60960?article_type=v

Høj overførselshastighed identifikation af synergistiske Drug kombinationer af overlapning2 metode
check_url/pt/60960?article_type=v

Høj overførselshastighed identifikation af regulerende gensekvenser ved hjælp af næste generations sekventering af cirkulære kromosom kropsbygning Capture (4C-seq)
check_url/pt/60960?article_type=v

Identifikation af fodspor af RNA: protein komplekser via RNA Immunopræcipitation i tandem efterfulgt af sekventering (RIPiT-SEQ)
check_url/pt/60960?article_type=v

Identifikation af værts veje, som er målrettet mod bakterielle Effector-proteiner ved hjælp af gær toksicitet og suppressor skærme
check_url/pt/60960?article_type=v

Forberedelse af meiotiske kromosomspreads fra zebrafisk spermatocytter
check_url/pt/60960?article_type=v

Inducerende Hairy Roots af Agrobacterium rhizogenes-MedieretTransformation i Tartary Boghvede (Fagopyrum tataricum)
check_url/pt/60960?article_type=v

Kromosomscreening af humane præimplantationsembryoner ved hjælp af brugt dyrkningsmedium: prøveindsamling og kromosomal ploidianalyse

Read Article