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Identificazione dei contatti Enhancer-Promoter nei corpi embrionali mediante Quantitative Chromosoma Conformation Capture (4C)
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Identification of Enhancer-Promoter Contacts in Embryoid Bodies by Quantitative Chromosome Conformation Capture (4C)
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Identificazione dei contatti Enhancer-Promoter nei corpi embrionali mediante Quantitative Chromosoma Conformation Capture (4C)

DOI:
10.3791/60960-v

•

10:02 min

•

April 29, 2020

•

, , ,
1Center for Genomic Regulation (CRG),The Barcelona Institute of Science and Technology, 2Universitat Pompeu Fabra, 3Vall d’Hebron Institute of Oncology

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:42Embyroid Body Generation
  • 02:51Dissociation of EBs
  • 03:48Fixation
  • 04:21Cell Lysis
  • 05:03Restriction Enzyme Digestion
  • 06:34DNA Shearing and Size Selection
  • 07:31Results: Enhance-Promoter Contacts During EB Differentiation
  • 09:13Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Segnaliamo l'applicazione della cattura della conformazione quantitativa del cromosoma seguita dal sequenziamento ad alto processo in corpi embrionali generati da cellule staminali embrionali. Questa tecnica consente di identificare e quantificare i contatti tra stimolatori e regioni promotrici di un determinato gene durante la differenziazione delle cellule staminali embrionali.

Tags

Keywords: 4CChromosome Conformation CaptureEnhancer-promoter ContactsEmbryoid BodiesMouse Embryonic Stem CellsGene RegulationCis-regulatory ElementsChromatin InteractionsCell CultureCell Differentiation

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