Journal
/
Genética
/
Identifiering av förstärkare-promotor kontakter i embryoid organ av kvantitativa kromosom konformation Capture (4C)
JoVE Journal
Genética
This content is Free Access.
JoVE Journal Genética
Identification of Enhancer-Promoter Contacts in Embryoid Bodies by Quantitative Chromosome Conformation Capture (4C)
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Identifiering av förstärkare-promotor kontakter i embryoid organ av kvantitativa kromosom konformation Capture (4C)

DOI:
10.3791/60960-v

•

10:02 min

•

April 29, 2020

•

, , ,
1Center for Genomic Regulation (CRG),The Barcelona Institute of Science and Technology, 2Universitat Pompeu Fabra, 3Vall d’Hebron Institute of Oncology

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:42Embyroid Body Generation
  • 02:51Dissociation of EBs
  • 03:48Fixation
  • 04:21Cell Lysis
  • 05:03Restriction Enzyme Digestion
  • 06:34DNA Shearing and Size Selection
  • 07:31Results: Enhance-Promoter Contacts During EB Differentiation
  • 09:13Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Vi rapportera tillämpningen av kvantitativa kromosom konformation fånga följt av hög genomströmning sekvensering i embryoid organ som genereras från embryonala stamceller. Denna teknik gör det möjligt att identifiera och kvantifiera kontakterna mellan förmodade förstärkare och promotorregioner av en viss gen under embryonal stamcellsdifferentiering.

Tags

Keywords: 4CChromosome Conformation CaptureEnhancer-promoter ContactsEmbryoid BodiesMouse Embryonic Stem CellsGene RegulationCis-regulatory ElementsChromatin InteractionsCell CultureCell Differentiation

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/60960?article_type=v

Skyndsam strålning Biodosimetry automatiserade av disentrisk kromosom identifiering (ADCI) och dos uppskattning
check_url/pt/60960?article_type=v

Poolade shRNA skärm för reaktivering av MeCP2 på inaktiva X-kromosomen
check_url/pt/60960?article_type=v

Generation av Genome-wide kromatin konformation fånga bibliotek från tätt stegvis tidiga Drosophila embryon
check_url/pt/60960?article_type=v

Hög genomströmning identifiering av synergistisk läkemedelskombinationer med överlappning2 Metod
check_url/pt/60960?article_type=v

Hög genomströmning identifiering av reglerande gensekvenser som använder nästa generations sekvensering av cirkulär kromosom konformation fånga (4C-seq)
check_url/pt/60960?article_type=v

Identifiering av spår av RNA: protein komplex via RNA immunoprecipitation i tandem följt av sekvensering (RIPiT-SEQ)
check_url/pt/60960?article_type=v

Identifiering av värdvägar riktade av bakteriella Effektorproteiner med hjälp av jäst toxicitet och suppressor skärmar
check_url/pt/60960?article_type=v

Beredning av meiotiska kromosom sprider sig från Zebrafish Spermatocytes
check_url/pt/60960?article_type=v

Inducera Hairy Roots av Agrobacterium rhizogenes-medierad transformation i tartary bovete (Fagopyrum tataricum)
check_url/pt/60960?article_type=v

Kromosomscreening av humana preimplantatoriska embryon med hjälp av använt odlingsmedium: provsamling och kromosomal ploidyanalys

Read Article