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Uma plataforma de espectrometria de massa de troca de hidrogênio (HDX-MS) para investigar enzimas biossintéticas de peptídeos
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Capítulos
- 00:04Introduction
- 00:36Bottom-Up Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) Reference Sample Workflow Preparation
- 01:18Reference Data Processing and Peptide List Definition
- 05:05Hydrogen-Deuterium Exchange (HDX) Reactions
- 06:36HDX Data Processing, Analysis, and Visualization
- 09:03Results: Reapresentative HDX-MS Peptide Biosynthetic Enzyme Evaluation
- 10:44Conclusion
As sintetizações lanthipeptide catalisam reações multistep durante a biossíntese de produtos naturais de peptídeos. Aqui, descrevemos um fluxo de trabalho contínuo, de baixo para cima, de espectrometria de massa de troca de hidrogênio -deutério (HDX-MS) que pode ser empregado para estudar a dinâmica conformacional das sintetizações de lanthipeptídeo, bem como outras enzimas semelhantes envolvidas na biossíntese de produtos naturais peptídeos.
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Keywords:
Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS)Protein Conformational DynamicsProtein Of InterestQuench BufferBottom-up Liquid Chromatography Mass SpectrometryProteomic Software ProgramFASTA FormatElectrospray MSEGlucan One Fiber No Peptide BNonspecific DigestCarbamidomethyl CApex 3DPeptide 3DIon Accounting
