Journal
/
Genética
/
Kortlægning i høj opløsning af protein-DNA-interaktioner i mus stamcelle-afledte neuroner ved hjælp af Chromatin Immunoprecipitation-Exonuclease (ChIP-Exo)
JoVE Journal
Genética
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Genética
High-Resolution Mapping of Protein-DNA Interactions in Mouse Stem Cell-Derived Neurons using Chromatin Immunoprecipitation-Exonuclease (ChIP-Exo)

Kortlægning i høj opløsning af protein-DNA-interaktioner i mus stamcelle-afledte neuroner ved hjælp af Chromatin Immunoprecipitation-Exonuclease (ChIP-Exo)

DOI:
10.3791/61124-v

•

08:40 min

•

August 14, 2020

•

,
1Department of Cell and Systems Biology,University of Toronto, 2Department of Biology,University of Toronto

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:21Antibody Incubation with Beads
  • 01:35Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
  • 02:56Enzymatic Reactions on Beads
  • 04:59Elution and Purification
  • 05:43Library Preparation
  • 06:50Results: ChIP-exo Produces High Mapping Resolution
  • 08:04Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Præcis bestemmelse af proteinbindende steder på tværs af genomet er vigtig for forståelsen af genregulering. Her beskriver vi en genomisk kortlægningsmetode, der behandler chromatin-immunoprecipitated DNA med exonuklease fordøjelse (ChIP-exo) efterfulgt af højgennemstrømning sekventering. Denne metode registrerer protein-DNA-interaktioner med nær base-pair kortlægning opløsning og høj signal-til-støj-forholdet i pattedyr neuroner.

Tags

Keywords: ChIP-exoProtein-DNA InteractionsChromatin ImmunoprecipitationHigh-resolution MappingMouse Stem Cell-derived NeuronsMagnetic BeadsBlocking SolutionIslet-1 AntibodySonicated LysatesWash BufferEnd Prep Reaction MixEnd Prep Enzyme Mix

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/61124?article_type=v

Kortlægning af RNA-RNA-interaktioner globalt ved anvendelse af biotinyleret psoralen
check_url/pt/61124?article_type=v

Genom-bred kortlægning af protein-DNA-interaktioner med ChEC-seq in<em> Saccharomyces cerevisiae</em
check_url/pt/61124?article_type=v

Chromatin-immunpræcipitation (ChIP) i mus-T-cellelinier
check_url/pt/61124?article_type=v

Retroviral Scanning: Kortlægning af MLV Integration Sites til at definere Cell-specifikke Regulatory Regions
check_url/pt/61124?article_type=v

Høj opløsning fluorescerende In Situ hybridisering i Drosophila fostre og væv ved hjælp af Tyramide Signal forstærkning
check_url/pt/61124?article_type=v

Kortlægning Genome-wide tilgængelige kromatin i primære humane T lymfocytter af ATAC-Seq
check_url/pt/61124?article_type=v

Promotor Capture Hej-C: Høj opløsning, Genome-wide profilering af promotor interaktioner
check_url/pt/61124?article_type=v

CRISPR-medieret reorganisering af kromatin løkke struktur
check_url/pt/61124?article_type=v

Høj opløsning sammenligning af bakteriel konjugation frekvenser
check_url/pt/61124?article_type=v

Kromatin Immunoprecipitation assay ved hjælp af Mikrococcal-nukleaser i pattedyrsceller

Read Article