Journal
/
Genética
/
Hoge resolutie mapping van eiwit-DNA interacties in muis stamcel-afgeleide neuronen met behulp van chromatine immunoprecipitation-exonuclease (ChIP-Exo)
JoVE Journal
Genética
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Genética
High-Resolution Mapping of Protein-DNA Interactions in Mouse Stem Cell-Derived Neurons using Chromatin Immunoprecipitation-Exonuclease (ChIP-Exo)
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Hoge resolutie mapping van eiwit-DNA interacties in muis stamcel-afgeleide neuronen met behulp van chromatine immunoprecipitation-exonuclease (ChIP-Exo)

DOI:
10.3791/61124-v

•

08:40 min

•

August 14, 2020

•

,
1Department of Cell and Systems Biology,University of Toronto, 2Department of Biology,University of Toronto

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:21Antibody Incubation with Beads
  • 01:35Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
  • 02:56Enzymatic Reactions on Beads
  • 04:59Elution and Purification
  • 05:43Library Preparation
  • 06:50Results: ChIP-exo Produces High Mapping Resolution
  • 08:04Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Nauwkeurige bepaling van eiwitbindende locaties in het genoom is belangrijk voor het begrijpen van genregulatie. Hier beschrijven we een genomische mapping methode die chromatine-immunogeprecipiteerd DNA behandelt met exonucleasevertering (ChIP-exo) gevolgd door sequencing met hoge doorvoer. Deze methode detecteert eiwit-DNA interacties met near base-pair mapping resolutie en hoge signaal-ruisverhouding bij zoogdierneuronen.

Tags

Keywords: ChIP-exoProtein-DNA InteractionsChromatin ImmunoprecipitationHigh-resolution MappingMouse Stem Cell-derived NeuronsMagnetic BeadsBlocking SolutionIslet-1 AntibodySonicated LysatesWash BufferEnd Prep Reaction MixEnd Prep Enzyme Mix

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/61124?article_type=v

Mapping RNA-RNA Interactions Globally Using Biotinylated Psoralen
check_url/pt/61124?article_type=v

Genoom-wide mapping van eiwit-DNA-interacties met ChEC-seq in<em> Saccharomyces cerevisiae</em
check_url/pt/61124?article_type=v

Chromatine Immunoprecipitatie (ChIP) in Muis T-cellijnen
check_url/pt/61124?article_type=v

Retrovirale Scanning: Mapping MLV Integration Sites om de specifieke codespecifieke regio's te definiëren
check_url/pt/61124?article_type=v

Hoge resolutie fluorescentie In Situ hybridisatie in Drosophila embryo's en weefsels met behulp van Tyramide signaal versterking
check_url/pt/61124?article_type=v

Toewijzing genoom-brede toegankelijk chromatine in primaire menselijke T lymfocyten door ATAC-Seq
check_url/pt/61124?article_type=v

Promotor Capture Hi-C: High-resolution, genoom-brede profilering van promotor interacties
check_url/pt/61124?article_type=v

CRISPR-gemedieerde reorganisatie van chromatine lusstructuur
check_url/pt/61124?article_type=v

Hoge resolutie vergelijking van bacteriële vervoeging frequenties
check_url/pt/61124?article_type=v

Chromatische immunoprecipitatie test met behulp van Micrococcal nucleasen in zoogdiercellen

Read Article