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蠕虫对齐和Worm_CP，两个开源管道，用于从卡诺哈布迪蒂斯精英获得的荧光图像数据的直化 和定量
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Worm-align and Worm_CP, Two Open-Source Pipelines for Straightening and Quantification of Fluorescence Image Data Obtained from Caenorhabditis elegans
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蠕虫对齐和Worm_CP，两个开源管道，用于从卡诺哈布迪蒂斯精英获得的荧光图像数据的直化 和定量

DOI:
10.3791/61136-v

•

11:16 min

•

May 28, 2020

•

, , , ,
1Babraham Institute

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:57Mounting Fixed Worms for Imaging
  • 02:56Creating Montage Images of Aligned Single Worms Using the Worm-align FIJI Pipeline
  • 06:01Analyzing Single-worm Fluorescence Intensity Using the Output from Worm-align in an Automated CellProfiler Pipeline
  • 08:07Results: Fluorescence Quantification with the Worm_CP Pipeline
  • 09:50Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

蠕虫对齐/Worm_CP 是一个简单的 FIJI/CellProfiler 工作流程，可用于拉直和对齐 卡诺哈布迪蒂斯埃利根样本 ，并评分全蠕虫图像为基础的检测，而无需事先的培训步骤。我们应用蠕虫对Worm_CP/分析方法，用于在活动物中对热休克诱导表达的定量，或在固定样品中对脂滴进行定量分析。

Tags

Worm-alignWorm CPCaenorhabditis ElegansFluorescence Image DataStraighteningQuantificationFijiCellProfilerMouth MicropipetteMounting MediumAgarose PadLevamisoleImage Analysis

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