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Un outil d’étude d’association de voies pour les analyses GWAS de l’information sur les voies métaboliques
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A Pathway Association Study Tool for GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
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Un outil d’étude d’association de voies pour les analyses GWAS de l’information sur les voies métaboliques

DOI:
10.3791/61268-v

•

05:01 min

•

July 01, 2020

•

,
1Institute for Genomics, Biocomputing & Biotechnology,Mississippi State University, 2Corn Host Plant Resistance Research Unit,USDA-ARS

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:32Genome-Wide Association Study (GWAS) Data Loading
  • 00:57Load Linkage Disequilibrium (LD) Data Loading
  • 01:26Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Assignment
  • 01:56Significant Pathway Discovery
  • 02:35Rugplot Visualization
  • 03:21Results: Representative GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
  • 04:21Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

En exécutant l’outil d’étude pathway association (PAST), soit via l’application Shiny, soit via la console R, les chercheurs peuvent mieux comprendre la signification biologique des résultats de leur étude d’association à l’échelle du génome (GWAS) en étudiant les voies métaboliques impliquées.

Tags

GWASGenome-wide Association AnalysisMetabolic PathwayPASTPathway Association Study ToolSNPsLinkage DisequilibriumGene AnnotationPathway AnalysisRug PlotsR ConsoleShiny

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