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Microsezione laser-cattura RNA-Sequenziamento per l'analisi dell'espressione genica spaziale e temporale specifica del tessuto nelle piante

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Biologia

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Laser-Capture Microdissection RNA-Sequencing for Spatial and Temporal Tissue-Specific Gene Expression Analysis in Plants

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Microsezione laser-cattura RNA-Sequenziamento per l'analisi dell'espressione genica spaziale e temporale specifica del tessuto nelle piante

DOI:

10.3791/61517-v

•

08:33 min

•

August 05, 2020

•

Lim Chee Liew², Yan Wang², Marta Peirats-Llobet, Oliver Berkowitz^2,3, James Whelan^2,3, Mathew G. Lewsey³

¹Department of Animal, Plant and Soil Science, AgriBio Building,La Trobe University, ²Australian Research Council Centre of Excellence in Plant Energy Biology,La Trobe University, ³Australian Research Council Research Hub for Medicinal Agriculture, AgriBio Building,La Trobe University

Capítulos

00:04Introduction
01:11Tissue Fixation
01:47Tissue Processing
02:38Paraffin Embedding
03:21Polyethylene Naphthalate (PEN) Membrane Slide Preparation
03:49Sectioning
04:53Laser-Capture Microdissection (LCM)
06:14Results: Representative LCM Sample Acquisition and RNA Quantification
07:52Conclusion

Summary

Tadução automática

Presentato qui è un protocollo per la microdissezione laser-cattura (LCM) di tessuti vegetali. LCM è una tecnica microscopica per isolare aree di tessuto in modo privo di contaminazione. La procedura include fissazione del tessuto, incorporamento di paraffina, sessazione, LCM e estrazione dell'RNA. L'RNA viene utilizzato nell'analisi dei trascrimi specifici del tessuto a valle e tempormente risolta.

Tags

Keywords: Laser-capture Microdissection RNA-sequencing Spatial Transcriptome Temporal Transcriptome Plant Cells Paraffin Embedding Barley Seed Vacuum Infiltration Dehydration Xylene Paraffin Infiltration

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